Térj vissza a világba, amiben két valóság létezik: a hétköznapi élet… és ami mögötte van. Ahhoz, hogy Neo rájöjjön, kicsoda is ő valójában, ismét követnie kell a fehér nyulat, hogy eljusson a Mátrixba. Már tudja, mit kell tennie. Arról viszont fogalma sincs, hogy a Mátrix veszélyesebb, mint valaha. Déja vu.